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納豆 には、人間に不可欠な必須アミノ酸群をバランス良く含んでおり、ビタミンＢ２・Ｅ・Ｋなどのビタミン群、カリウム・亜鉛・カルシウム・鉄などのミネラル成分、食物繊維などの栄養素も豊富に含まれています。納豆の原料は大豆なのですがこの大豆も栄養成分も高い食品です。
しかし、大豆も生のままでは組織が硬く，消化されにくいという欠点がありました。
納豆菌による酵素分解の働きによってその欠点を解消し、大豆のいい栄養素であるタンパク質や炭水化物，脂肪分などはそのままで消化吸収の良い食品になりました。

納豆菌は、善玉菌の増殖を助けて整腸作用を発揮することで便通を改善します。また悪玉菌がつくる腐敗産物の生成を減らし、有害物質を吸着して排泄を促すことから肝臓の負担を軽くし、肌などにもよい影響を与えると言われています。

また納豆菌がつくる酵素のひとつに「ナットウキナーゼ」があります。この「ナットウキナーゼ」は 納豆だけが含む酵素で、血液の流れをサラサラにし、脳卒中や心筋梗塞、動脈効果など生活習慣病予防に役立つとされています。

他にも納豆や原料の大豆に含まれる「イソフラボン」は、更年期の、特に女性ホルモンに働きかけ、骨粗鬆症の予防や美肌・美白の効果がある成分として注目されています。
納豆には疲労回復、整腸作用、便通促進、滋養強壮、コレステロールの代謝 を促す、免疫力アップ効果、活性酸素の働きを抑え体の老化やがんを防ぐ、肌や皮膚を若々しく保つなどの効果が期待できます。